В серии пенальти со счётом 6:5 победили гости. Всё первенство ногинские футболисты прошли в лидерах вместе с клинским «Титаном». После важнейшего домашнего матча с клинчанами, проигранного «федотовцами» со счётом 0:1, в протоколе была сделана запись об участии в игре не заявленного клинского футболиста. Разгорелся скандал. Клинчанам засчитали поражение, но и в составе ФК «Ногинск» обнаружили игрока, который не мог выходить на поле из-за перебора жёлтых карточек. Причём, не только в «криминальной» игре с «Титаном», но ещё и с «Нарой-Десной-2». В итоге с ногинчан сняли 6 очков, а заветное второе место, позволявшее выйти в группу «А», досталось долгопрудненцам (на первом удержался «Титан»). Самое обидное, что дисквалифицированный ногинский футболист в игре с Клином на поле не вышел, а лишь ошибочно был внесён в протокол. ФК «Ногинск» остался третьим, в 30 матчах одержав 19 побед, 3 раза сыграв вничью и 8 встреч проиграв, разность забитых и пропущенных мячей – 63:46.
21 мая 2006 года начали выступления во всероссийском турнире ветеранов ногинские футболисты, обретшие нового спонсора – фирму «Айтакс». Их первым соперником стала сильная команда «Динамо-Люксойл» из города Пушкино. В стартовом составе ногинчан вышли И.Князев, А.Ермохин, П.Корягин, С.Бучнев, Р.Абульханов, С.Частухин, Ю.Митюшин, А.Корягин, А.Гордеев,
А.Соколов, И.Кукин. Первый мяч забили гости (Колобаев). Но затем наши ветераны трижды огорчили вратаря противника (два раза Кукин и Митюшин). В концовке гости сократили разрыв (мяч забил Крутов), но победа осталась за ногинчанами – 3:2. Зональный турнир первенства страны подопечные В.И.Евсикова снова завершили на третьем месте вслед за пушкинскими данамовцами и ФК «Коломна». 15 мячей у ногинского «Айтакса» забил Игорь Кукин.
Традиционный футбольный турнир ветеранов старше 40 лет, посвящённый памяти Вячеслава Гречишкина, выиграла команда «Восток-Сервис». Второе место у любителей кожаного мяча из Ногинского мясокомбината, третье – у команды «МОГЭС – Боевое братство». 24 июня прошёл турнир детских команд 1995 – 1996 гг.р., посвящённый Дню молодёжи. В нём приняли участие 11 команд из Ногинска, Купавны, Обухова и посёлка имени Воровского. В трёх группах на предварительном этапе определились три финалиста – «Обухово-1», «Знамя» и «Электроугли».