Генеральным директором и главным тренером коллектива стал Юрий Иванович Кобяков, тренерский штаб составили Юрий Павлович Крючков и Игорь Вячеславович Князев, функции начальника команды и администратора выполняли Павел Александрович Корягин и Владимир Викторович Ширшов соответственно.
В ходе подготовки к сезону ФК «Ногинск» дважды встретился с электростальским клубом «Восток-ЭЗТМ» и одержал победы – 4:1 и 3:0. В апреле-месяце ногинчане приняли участие в Кубке Федерации футбола Московской области памяти В.А.Ефремова. В группе «В» (в Бронницах) они сыграли вничью с «Метеором-Ильинкой» из Жуковского – 1:1 и ФК «Серебряные Пруды» – 0:0, а затем потерпели поражения от СК «Бронницы» – 1:2 и мытищинской «Фортуны» – 0:4 и выбыли из борьбы за Кубок.
11 мая 2005 года ФК «Ногинск» в первой официальной игре российского первенства принял команду из Серебряных Прудов. Драматичный поединок, в котором оба соперника успели побывать в роли ведущего в счёте, закончился победой ногинчан – 4:2. Во второй игре с ФК «Королёв» ногинчане атаковали больше. Но очень плохо действовали игроки обороны, пытавшиеся применить новую схему игры «в линию». В результате практически все мячи в ворота ФК «Ногинск» были забиты после выходов один на один с вратарём, а команда потерпела фиаско – 0:5. Сезон ФК «Ногинск» завершил на шестом месте, хотя на протяжении всего турнира располагался в таблице выше. Ногинчане одержали 13 побед, 4 матча свели вничью и 9 раз проиграли, забили 58 мячей, пропустили 48.
Для подготовки ближайшего резерва была создана дублирующая команда ФК «Ногинск-2» (тренер – Игорь Вячеславович Князев), выступавшая в зоне «А» второй группы первенства Московской области. В матчах первенства области было разрешено выступать пятерым игрокам из состава команд, играющих в турнире ЛФК.
Упорно прошли полуфиналы Кубка Ногинского района-2005. «Торпедо-НЗТА» по сумме двух встреч уступило купавинскому «Мосхиму» – 1:4 и 3:2, а «Старт-РТИ» взял верх над обуховской «Юностью» – 5:0 и 2:3. 20 июня в финальном поединке «Мосхим-Купавна» – «Старт-РТИ» всё шло к нулевой ничьей. У ногинчан хорошо играли голкипер Андрей Чеченин, братья Хохловы, Дмитрий Струнов.
