Сезон «Автомобилист» начал с поражения в матче Кубка России от «Краснознаменска», только что возвратившегося во второй дивизион из турнира коллективов физкультуры и усилившего свой состав такими футболистами, как Нейман и Середа. Старт же в первенстве страны был более удачным: ногинчане дома с одинаковым счётом 1:0 обыграли «Волочанин-89» (Вышний Волочёк) и «Спартак» (Щёлково), а затем, после поражения в Ярославле (1:2), на выезде одолели спартаковцев Костромы (3:0). Какое-то время «Автомобилисту» удавалось удерживаться в лидирующей группе. Однако неудачные выступления на своём поле (6 поражений и 5 ничьих), безвольная игра против аутсайдеров (в матчах с командами, занявшими пять последних мест в турнирной таблице, «Автомобилист» потерпел 6 поражений, из них 3 – дома) и затянувшаяся с 24 по 31 туры безвыигрышная серия (5 поражений подряд, из них 3 – на своём поле) отодвинули ногинчан на итоговое одиннадцатое место (всего – 13 побед, 9 ничьих, 14 поражений, мячи – 35:34). Характерно, что показатели «Автомобилиста» в матчах против пяти сильнейших по итогам сезона команд западной зоны лучше, чем против пяти слабейших. Так, к примеру, вологодское «Динамо», занявшее второе место, было повержено дважды (оба раза – 1:0), в то время как «Сатурну-2» и великолукской «Энергии», финишировавшим на 18 и 19-м местах, ногинчане оба матча проиграли. Этот факт говорил о перспективных возможностях команды. В сложившихся условиях направление на омоложение состава и привлечение в коллектив воспитанников ногинского футбола и игроков из ближайших городов можно было считать едва ли не единственно верным, хотя и не приносящим быстрого результата. Ну а молодёжи, безусловно, было необходимо время для того, чтобы набраться опыта и уверенности. Сделать это было легче рядом с такими лидерами «Автомобилиста», как защитник Михаил Чернов и полузащитник Дмитрий Батынков. Проблемой команды в сезоне-2000 стало отсутствие острого и забивающего форварда. Не справились с этой ролью Шальнев и Жданов. В ряде матчей брал игру на себя Сухов. А молодому Канцеву, обладавшему голевым чутьём, не хватало физических данных. В результате в 36 матчах ногинским футболистам удалось забить только 35 мячей.

По завершении зонального турнира российского первенства И.С.Волчок сказал: «Наши последние матчи, думаю, произвели впечатление на зрителей. Да и в целом сезон можно считать неплохим.