В 1981 году «Памир» выигрывает зональные соревнования (игры вновь проходили в Душанбе), но в 1/8 финала его выбили из дальнейшей борьбы динамовцы Минска, победившие — 1:0.
В 1982 году душанбинцы выступали в Бакинской зоне, где
из пяти проведенных встреч выиграли только две.
В матче с киевским СКА еще один свой рекорд результативности установил В. Турсунов, забивший в ворота армейцев три мяча. Это был первый и пока единственный «хет-трик» душанбинцев в кубковых играх.
В 1983 году кубковые соревнования вновь стали проходить по прежней формуле и в 1/32 финала «Памир», проиграв на своем поле «Ротору» — 0:1, сразу же выбыл из текущего розыгрыша. „
В 1984 году душанбинцы после ничьей в основное и дополнительное время с динамовцами Кирова, удачно пробили пенальти, но выйдя в следующий круг, уступили «Жальгирнеу»
В том же году стартовал и следующий кубковый турнир, который теперь было решено проводить в течении двух сезонов. «Памир» «вылетел» сразу же, проиграв в Краснодаре «Кубани» но пенальти.
Матчи розыгрыша кубка СССР 1985—1986 годов душанбинцы начали- с командами второй лиги («Сурхан», «Колхети»), обыграв которые вышли в 1/16 финала, где проиграли затем в Минске местным динамовцам.
С 1986 года душанбинцы проводят свои кубковые встречи на редкость неудачно, проигрывая командам второй лиги. Правда, стоит отметить, что в этих играх «Памир» далеко не всегда выступал в своем основном, боевом составе. К примеру, в своем последнем кубковом поединке в мае 1988 года, который проходил в Хабаровске, честь клуба защищали игроки, многие из которых впервые в этот день надели футболки «Памира» (О. Назаров, Г. Тахохов, А. Аваков, А. Зангиев, Т. Муминов, С. Ишанходжаев).
Свой юбилейный, 20-й по счету сезон «Памир» впервые готовился провести в ранге команды высшей лиги отечественного футбола.