Он также принимал участие в урегулировании многих спорных дел, начиная со знаменитого «удара кунг-фу» Кантоны в 1995 году до скандала с займами «Спурс». Будучи остроумным человеком, Келли не раз высказывал свое недружелюбное отношение к прессе, например, на жеребьевках матчей на Кубок ФА, которые транслировались по телевидению. В декабре 1998 года Келли был вынужден оставить должность генерального секретаря Футбольной ассоциации из-за обвинений в коррупции при подаче заявки Англии на проведение Кубка мира в 2006 году. Его обвиняли в том, что он санкционировал выдачу кредита в размере 3 млн 200 тыс. фунтов стерлингов для Футбольной ассоциации Уэльса.

Преемник Келли Адам Крозье, занявший его пост в январе 2000 года, предпринял усилия порвать со старой традицией. Он никогда раньше не работал в футболе, а занимался рекламой. Его назначение свидетельствовало о том, что ФА ищет новых специалистов, которые помогли бы английскому футболу развиваться с учетом быстро меняющейся обстановки в международном футболе.

Широкая популярность азартных игр среди аристократии и рабочего класса, а также привлекательность самого футбола способствовали тому, что уже с 1870-х годов ставки на результаты матчей стали неотъемлемым элементом футбола. Вспоминают, что многие рабочие, присутствовавшие на финальном матче розыгрыша Кубка Футбольной ассоциации 1887 года между клубами «Вест Брумвич Альбион» и «Астон Вилла», рисковали своим недельным заработком, чтобы угадать исход поединка, но большинство ставок все же делалось за пределами стадиона в виде купонов с фиксированным соотношением через букмекеров либо через местную прессу. Поскольку общественные стражи нравственности усматривали в азартных играх одну из причин разорения рабочего класса, футбольные власти не одобряли усилий букмекеров и спортивной прессы по организации тотализатора со ставками на результаты матчей. Такая позиция в футболе сохранялась до второй половины 1920-х годов, когда для британских любителей футбольных ставок была организована система пулов (футбольный тотализатор).